Nanofiltrasyon (NF) membranları ile ters ozmoz (RO) membranları arasındaki temel farklar su filtreleri filtreleme doğruluğu, uzaklaştırılan madde türleri ve uygulama senaryolarıdır. RO membranları, yaklaşık 0,0001 mikron gözenek boyutuyla filtreleme doğruluğuna sahiptir ve bakteriler, virüsler, ağır metaller, tuzlar ve tüm organik maddeler dahil tüm çözünmüş katıları giderebilir. Buna karşılık, NF membranların filtrasyon doğruluğu, yaklaşık 0,001-0,01 mikron gözenek boyutuyla mikrofiltrasyon ile ters ozmoz arasındadır ve esas olarak iki değerlikli ve çok değerlikli iyonları (kalsiyum, magnezyum, sülfat gibi), bazı organik maddeleri ve Daha büyük moleküler kirleticiler, bazı tek değerlikli iyonların (sodyum ve klorür gibi) geçmesine izin verir.
Kaldırılan madde türleri açısından, RO membranları sudaki iyonları, çözünmüş katıları, ağır metalleri (cıva, arsenik), nitratları, florürleri, bakterileri, virüsleri ve organik bileşikleri giderebilir ve çözünmüş tüm yabancı maddeler giderilecektir. NF membranları temel olarak iki değerlikli ve çok değerlikli iyonları (kalsiyum ve magnezyum gibi sertlik iyonları gibi), bazı organik bileşikleri (bazı pestisitler ve gübreler gibi), renkleri ve kokuları giderirken, bazı tek değerlikli iyonları (sodyum ve klor gibi) tutar. Sudaki bazı doğal mineraller muhafaza edilebilir.
RO membranları, içme suyu arıtma, deniz suyunun tuzdan arındırılması, endüstriyel ultra saf su hazırlama ve laboratuvar suyu gibi yüksek saflıkta su kalitesi gerektiren uygulamalar için uygundur. NF membranları, ev tipi içme suyu arıtma (bazı mineralleri muhafaza etme), hafif endüstriyel atık su arıtma, yiyecek ve içecek işleme vb. gibi sertliğin ve bazı organik maddelerin kısmen giderilmesini gerektiren uygulamalar için uygundur.